德国普通大学研究生吗？
1. 作为工科博士，来给你简单介绍一下德国读研的情况。(关于申请德国大学，可以参考我以前的回答) 德国大部分大学的硕士是没有课程设置的，也就是不需要学生念书，只需要做课题就可以了。当然，也有一部分大学部分专业是有授课型硕士的（TU9里只有DSL有，而且要求是本科相关专业的毕业生）。
对于硕士是否上课还是做课题，取决于你所读的专业。以工学为例，除了个别项目（如亚琛工大FSI有50%的课程设置，慕尼黑工大也有类似的项目）基本都是做课题。原因也很简单，德国本科基本都是选课的模式，绝大多数同学本科毕业的时候都没有完成所有必修和选修的课程，所以为了毕业需要来完成未修的课程；另外，很多德国大学本科的授课语言并不是德语，而是英语，因此需要过渡。
2. 你现在的问题是申请到好学校好专业的问题。这个问题就仁者见仁智者见智了。我觉得如果你确定留在德国工作，那么申请TU9或者FH这种级别的大学意义不大（从就业角度来看）。因为这些学校的课程设置都是按照传统德国本科的方式来的，你不可能拿到这样的学位后可以直接找到工作。(当然，如果你有钱，愿意花大把时间耗在这种有可能拿不到工资的学习上，那另当别论哈)
所以我个人建议是，如果你打算毕业后留德找工作，那么就不要申请了。直接来投简历面试。如果成功机会大一些。相反，如果你考虑回国发展，那么可以申一下这些学校，选择他们要求较低的专业去读。因为有了这个学位，至少回去就业找起点会高些。
3. 对于学费问题，现在德国的政策是这样的，本科生（包括预科生）没有身份的学生收学费，但研究生没课的时候也可以自由进出实验室，跟有身份的研究生一样对待。